Eine Form der Arbeit im Versöhnungsbund sind die sogenannten Kommissionen. Dies sind Gruppen, die einzelne dem VB wichtige Themen kontinuierlich über mehrere Jahre bearbeiten.
Manche von ihnen treffen sich mehrmals im Jahr und bereiten auch Einheiten für die Jahrestagung vor. Eine Mitarbeit steht auch Nichtmitgliedern offen, von daher sind sie auch eine Gelegenheit den Versöhnungsbund kennenzulernen.
Zurzeit sind insbesondere folgende Kommissionen aktiv:
- die Beloved Communities Kommission - Anti-Rassismus-Arbeit
- der Arbeitskreis Friedensauftrag und Militär
- die Kommission Friedensbildung
- die Kommission Friedenstheologie
- die Kommission GFK
- die Gender-Kommission
- die Indien-Kommission
- die Kommission Leben in Gerechtigkeit — Umwelt, Wirtschafts- und Sozialökologie